Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rtel1Q0VGM9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rtel1Q0VGM9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms