Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttc39dQ0VF76 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc39dQ0VF76 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc39dQ0VF76 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms