Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rundc1Q0VDN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rundc1Q0VDN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rundc1Q0VDN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms