Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms