Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntnap5bQ0V8T8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cntnap5bQ0V8T8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms