Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zc3h18Q0P678 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zc3h18Q0P678 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms