Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Neurl1bQ0MW30 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Neurl1bQ0MW30 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Neurl1bQ0MW30 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.1 ms