Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf541Q0GGX2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf541Q0GGX2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf541Q0GGX2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms