Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnnm1Q0GA42 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnnm1Q0GA42 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnnm1Q0GA42 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms