Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cass4Q08EC4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cass4Q08EC4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms