Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp2Q08652 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbp2Q08652 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms