Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MestQ07646 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MestQ07646 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MestQ07646 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MestQ07646 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MestQ07646 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MestQ07646 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MestQ07646 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MestQ07646 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MestQ07646 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms