Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrstQ06666 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms