Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PtprgQ05909 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PtprgQ05909 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PtprgQ05909 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms