Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SryQ05738 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SryQ05738 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SryQ05738 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SryQ05738 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SryQ05738 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SryQ05738 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SryQ05738 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SryQ05738 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SryQ05738 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SryQ05738 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SryQ05738 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SryQ05738 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SryQ05738 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SryQ05738 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SryQ05738 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SryQ05738 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SryQ05738 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SryQ05738 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SryQ05738 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms