Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox13Q04891 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox13Q04891 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms