Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Emx2Q04744 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms