Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nf1Q04690 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms