Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RelaQ04207 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RelaQ04207 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms