Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kcnb1Q03717 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnb1Q03717 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnb1Q03717 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms