Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Msx2Q03358 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Msx2Q03358 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms