Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Thbs2Q03350 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms