Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GscQ02591 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GscQ02591 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GscQ02591 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GscQ02591 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GscQ02591 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GscQ02591 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GscQ02591 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GscQ02591 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GscQ02591 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GscQ02591 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GscQ02591 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GscQ02591 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GscQ02591 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GscQ02591 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GscQ02591 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GscQ02591 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms