Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nhlh1Q02576 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nhlh1Q02576 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nhlh1Q02576 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms