Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Htr1fQ02284 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr1fQ02284 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms