Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snai1Q02085 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snai1Q02085 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms