Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ly9Q01965 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms