Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxd1Q01822 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd1Q01822 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd1Q01822 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms