Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Top2aQ01320 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Top2aQ01320 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Top2aQ01320 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Top2aQ01320 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms