Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gja5Q01231 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja5Q01231 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms