Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2cQ01098 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin2cQ01098 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin2cQ01098 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms