Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Grin2bQ01097 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Grin2bQ01097 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Grin2bQ01097 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Grin2bQ01097 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms