Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PrcdQ00LT2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms