Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rbp4Q00724 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms