Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GabpaQ00422 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GabpaQ00422 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms