Protein–RNA interactions for Protein: P98197

Atp11a, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11aP98197 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp11aP98197 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp11aP98197 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms