Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cds1P98191 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cds1P98191 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cds1P98191 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms