Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rbbp6P97868 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rbbp6P97868 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp6P97868 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms