Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms