Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pitx2P97474 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pitx2P97474 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms