Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LystP97412 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LystP97412 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LystP97412 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LystP97412 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LystP97412 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LystP97412 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LystP97412 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LystP97412 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LystP97412 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LystP97412 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LystP97412 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LystP97412 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LystP97412 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LystP97412 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LystP97412 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LystP97412 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LystP97412 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LystP97412 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LystP97412 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LystP97412 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LystP97412 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LystP97412 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms