Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps45P97390 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vps45P97390 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vps45P97390 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms