Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pkp1P97350 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pkp1P97350 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms