Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Nkx2-3P97334 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nkx2-3P97334 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms