Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf1P84078 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf1P84078 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf1P84078 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms