Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nucb2P81117 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms