Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cct5P80316 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cct5P80316 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms