Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Otx2P80206 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Otx2P80206 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otx2P80206 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms