Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ErfP70459 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ErfP70459 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ErfP70459 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ErfP70459 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ErfP70459 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ErfP70459 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ErfP70459 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ErfP70459 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ErfP70459 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms