Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgf11P70378 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fgf11P70378 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms